郑成功死后原葬台南近郊洲仔尾（今属永康
郑成功墓
区）；郑克塽降清迁居北京后，上疏表示“念台湾远隔溟海，祭扫维艰”，请迁内地。1699年（康熙三十八年）五月，郑成功父子迁葬福建省南安市康店村覆船山，附葬于七世祖郑乐斋坟墓内。也有说法称，为免台湾人起抗清之心，郑氏诸祖在台诸坟悉遭朝廷下令迁葬中国大陆。
民间传说郑克塽为了使郑成功安眠地下，不再受干扰，护送郑成功灵柩从北京到固始郑家飨堂安葬。另一方面，为了遮人耳目，又派其弟郑克举到福建南安刻了一块《郑氏附葬祖父墓志》，声称郑成功附葬在“郑氏乐斋公茔”祖坟里。但此说并无具体证据支持。