早于慕容垂投奔前秦之时，王猛都对其颇有戒心，曾对苻坚说：“慕容垂父子，就如龙虎，不是可以驯服的人，若果他日其假借时势，就不可能控制了，不如早日除去他们。”但苻坚拒绝。及至王猛于公元369年（建元五年）出发进攻洛阳时，慕容垂在与王猛饮酒时送了他的佩刀给王猛。因慕容垂长子慕容令参王猛军事随军，王猛就买通慕容垂的亲信金熙假称慕容垂使者，向慕容令假称慕容垂将在长安叛秦东归。慕容令整天犹豫，但因为不能找到父亲查证，最终还是假称出猎而投奔前燕。王猛于是乘机上表慕容令叛变，吓得慕容垂出走蓝田（今陕西蓝田县），但苻坚追还慕容垂后没有加罪，仍旧善待他。相反慕容令始终不被前燕所信赖，最终起兵失败被杀。(参见金刀计)

王猛积劳成疾，终于在公元375年（建元十一年）六月病倒了。苻坚亲为王猛祈祷，并派侍臣遍祷于名山大川。碰巧王猛病情好转，苻坚欣喜异常，下令特赦死罪以下。王猛上书说：“想不到陛下因贱臣微命而亏损天地之德，自开天辟地以来绝无此事，这真使臣既感激又不安！臣听说报答恩德最好的办法是尽言直谏，请让我谨以垂危之命，敬献遗诚。陛下威烈震慑八方荒远之地，声望德化光照六合之内；九州百郡，十居其七；平燕定蜀，如拾草芥。然而善作者未必善成，善始者未必善终。所以，古来明君圣王深知创业守成之不易，无不战战兢兢，如临深渊。恳望陛下以他们为榜样，则天下幸甚！”苻坚读一行字，抹两行泪，悲恸欲绝。这年七月，苻坚见王猛病危，赶紧询问后事。王猛睁开双眼，望着苻坚说：“晋朝虽然僻处江南，但为华夏正统，而且上下安和。臣死之后，陛下千万不可图灭晋朝。鲜卑、西羌降伏贵族贼心不死，是我国的仇敌，迟早要成为祸害，应逐渐铲除他们，以利于国家。”说完便停止了呼吸。苻坚三次临棺祭奠恸哭，对太子苻宏说：“老天爷是不想让我统一天下呀，怎么这样快就夺去了我的景略啊”。于是，按照汉朝安葬大司马大将军霍光那样的最高规格，隆重地安葬了王猛，并追谥王猛为“武侯”——如同蜀汉追谥诸葛亮为“忠武侯”（世人简称“武侯”）一样。秦国上下哭声震野，三日不绝。

苻坚常把自己与王猛的关系比为刘备与诸葛亮的关系，但刘备比孔明年长二十岁，而苻坚却比王猛小十三岁，所以尽管限于君臣名分，苻坚却始终把王猛当作兄长敬重，双方感情极为深厚。王猛五十一岁死时，苻坚才三十八岁；一旦失去这位兄长、老师和最得力的助手，苻坚顿时陷于极度悲痛之中，经常潸然泪下，不到半年便已须发斑白了。半年之中，苻坚恪遵王猛遗教，兢兢业业地处理国事，着重抓了扩大儒学教育和关心民间疾苦两件大事，并且都大有成效。其后，苻坚迅速灭掉前凉和代国，完全实现了北方的统一，东夷、西域六十二国和西南夷都遣使前来朝贡；原属东晋的南乡、襄阳等郡（辖境在今湖北）也被攻夺下来。至此，前秦臻于极盛。

遗憾的是，苻坚后来忘记了王猛的遗教，于王猛死后八年的公元383年（建元十九年）不顾群臣的普遍反对，悍然调集九十余万大军进攻东晋，结果在淝水（在今安徽境内）之战中一败涂地。而王猛叮嘱再三要苻坚除掉的鲜卑、羌族上层阴谋分子，如慕容垂、慕容冲、姚苌之流，因为未被除掉，这时便乘机举兵造反，纷纷割据自立，把前秦的一统江山搅得七零八落。到了建元二十一年，苻坚被姚苌杀害了，年仅四十八岁。又过了九年，前秦也终于灭亡。大分裂的局面一直延续到公元439年（元嘉十六年）北魏统一北方才告一段落。

王猛临终遗言（包括疏文），寥寥数语，却都关系到前秦国家的兴衰存亡，可谓一言九鼎，胜过千言万语。他死后八年的历史结局完全证实了他非凡的远见。苻坚在淝水惨败后经常痛悔自己忘记王猛遗言的大错，但已悔之晚矣，终成千古之恨。